De acuerdo a la carpeta de investigación realizada por la Procuraduría General de Justicia de la Ciudad de México, los posibles motivos del asesinato de Leonardo Avendaño se deberían a actos de celos por parte del sacerdote hacia el seminarista.

La policía de investigación reveló fueron encontradas fotos sexuales con Francisco Javier, el sacerdote detenido, y otros párrocos en el teléfono y iPad del joven.

Las fotografias mostraban orgias homosexuales entre varios parrocos de la iglecia en diversas posiciones. Felatio y sodomiia en plena sacristia.

Asimismo, la investigación señala que Avendaño “no trabajaba, ayudaba a oficiar misas; y conseguia diversas drogas como cocaina para los sacerdotes".

Se sospecha que el asesinato sea una posible venganza por parte del agresor debido a que Leonardo había iniciado recientemente una relación sentimental con una joven.